1. Invalidate Caches and Restart

File - Invalidate Caches / Restart... 클릭

Invalidate and Restart 클릭
2. VCS - Refresh File Status

프로젝트 루트를 선택한 상태에서 VCS - Refresh File Status를 클릭한다.
3. IntelliJ VCS Log 삭제
아래 디렉토리 하위의 파일들을 삭제한다.
C:\Users\{사용자이름}\.IntelliJIdea2019.3(버전에 따라 상이함)\system\vcs-log
4. [추가] Disable Show Unversioned Files
커밋 창에서 unversioned 파일을 굳이 보이지 않게 함으로써 인텔리J에서 커밋 속도를 향상시킬 수 있다.